作为中国现存最早的官方档案文件汇编和第一部史书，《尚书》不仅为“七经之冠冕，百氏之襟袖”，而且也具有丰富的历史与文化价值，迄今已形成一个专门之学——“《尚书》学”。与传统的“《尚书》学”不同，当代的“《尚书》学”已不仅仅是对“《尚书》”这一概念下的系列文献及其义理的研究与阐发，而是对包括传统《尚书》系列文献、《逸周书》、“书”类文献逸篇逸文等在内的“书”类文献全体有关的文本、人物、史事、地理、制度、经学义理、历史思想、哲学等各方面的研究。其中，李学勤对《尚书》学研究作出了较为突出的贡献。

　　辨析“书”类文献源流与《尚书》真伪问题

　　李学勤对《尚书》真伪问题的认识基于他对古书流传状况的判定。他一再强调“史料不是只用真假来判断，而是有可行性高低的问题”，并将新出简帛书籍与传世古书进行对比，提出了古书流变的十种情形：佚失无存、名亡实存、为今本一部、后人增广、后人修改、经过重编、合编成卷、篇章单行、异本并存、改换文字。由此重新判别古书的真伪问题，认为“总的说来，除了少数经籍早已被立于学官，或有官本之外，古籍一般都要经过较大的改动变化，才能定型”（李学勤：《简帛佚籍与学术史》，江西教育出版社2001年版）。

　　他对《尚书》真伪问题的认识可以大致分为前后两个阶段。早年，囿于文献不足，在学界独尊阎若璩《尚书古文疏证》辨伪成果的氛围下，他另辟蹊径，发展了陈寅恪的观点，主张重新认识梅赜所献《孔传古文尚书》的来历与文献价值。俞大维《怀念陈寅恪先生》记陈寅恪论《古文尚书》言：“不可武断地说，它是全部杜撰的书，绝非一人可杜撰，大致是根据秦火之后，所传零星断简的典籍，采取有关《尚书》部分所编纂而成，所以我们要探索伪书的来源，研究其所用资料的可靠性，方能慎下结论；不可武断地说，它是全部杜撰的。”（《陈寅恪先生论文集》，三人行出版社1974年版）李学勤亦言“传闻陈寅恪先生曾认为古文《尚书》非一人所能杜撰，大约是根据秦火以后所传零星断简，采取有关部分编纂而成”（《简帛佚籍与学术史》），并先后撰写了《西汉河内女子得逸书考》《论魏晋时期古文〈尚书〉的传流》《〈今古学考〉与〈五经异义〉》《论孔子壁中书的文字类型》《〈尚书孔传〉的出现时间》《竹简〈家语〉与汉魏孔氏家学》等文章，系统梳理了汉魏之时各种《尚书》文本及相关文献的传流情况，为解决梅献本《古文尚书》及其“孔安国传”、《孔子家语》《孔丛子》等相关文献的文献学悬案提供了思考的方向，并带动了一系列成果的问世。

　　李学勤晚年成功促成一批战国竹简入藏清华大学，学界循例称作“清华简”。作为近代以来首次出现整篇“书”类文献的简帛文献，清华简的现世，为解决千年《尚书》悬案提供了有力的实物证据和前所未见的文献材料。他利用清华简这批新材料，推翻了自己早年的观点，通过对清华简《尹诰》与梅献本《咸有一德》等篇的考察，最终认定传世梅献本《古文尚书》中《大禹谟》等二十五篇为伪作。